PDBフォーマット - PDBx/mmCIF 変換サービス

アップロードした分子構造データファイルを別の書式に変換します。 アップロードしたファイルのタイプは自動的に判定されます。 mmCIFファイルの場合はPDBファイルに、PDBファイルの場合はmmCIFファイルに変換されます。 gzip圧縮されたファイル(ファイル名の末尾が「.gz」であるファイル)でも扱うことができます。この場合、変換後のファイルもgzip圧縮されたものになります。

1. 変換元ファイルの指定

変換元ファイルを指定して下さい。アップロードできるファイルの大きさは最大 2MB です。


巨大構造のmmCIFファイルをPDB形式に変換する場合、以下のように取り扱います。

高分子構造のフォーマット変換にはRCSB PDBのMAXITを使っています。このプログラムをローカルにインストールすればローカルでフォーマット変換を行うことができます。

一部の非圧縮ファイルでアップロードできないという問題が確認されおり、現在調査を行っています。このような問題が発生した場合、gzip圧縮をかけてアップロードしてみてください。